{
  "abstract": "Background Variants in the dentin sialophosphoprotein ( DSPP) gene are associated with dentin dysplasia type II (DD-II; OMIM # 125420) and dentinogenesis imperfecta (DI) types II (OMIM # 125490) and III (OMIM # 125500). DSPP encodes a precursor protein cleaved into three dentin matrix proteins: dentin sialoprotein (DSP), dentin phosphoprotein/phosphophoryn (DPP) and dentin glycoprotein (DGP). Exon 5 contains over 200 tandem 9-base pair repeats (DSS domain), complicating sequencing with standard methods.Materials and methods We studied 112 individuals (42 index cases and 70 relatives) with clinical signs of DI or DD. DNA extracted from saliva was analysed using the GenoDENT next-generation sequencing panel. For inconclusive cases, long-range PCR and Oxford Nanopore Technology (ONT) long-read sequencing were used to overcome limitations in analysing the repetitive DSPP region.Results Pathogenic or likely pathogenic DSPP variants were identified in 41 families, including 8 known and 14 novel variants. Most were in exon 5, causing frameshifts resulting in a −1 reading-frame shift with a hydrophobic C-terminal extension and termination at a downstream stop codon. ONT sequencing enabled detection in cases where short-read methods failed. Several variants showed familial segregation and variable expressivity.Conclusion This study demonstrates the value of long-read sequencing to resolve complex DSPP regions and expands the variant spectrum. The variability in clinical presentation suggests the influence of modifier factors, warranting further genotype–phenotype studies.",
  "authors": [
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Gaétan Caravello"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Université de Strasbourg, INSERM U1258, CNRS-UMR7104, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France"
      ],
      "name": "Alexandra Jiménez-Armijo"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Université de Strasbourg, INSERM U1258, CNRS-UMR7104, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France"
      ],
      "name": "Marzena Kawczynski"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Tristan Rey"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Université de Strasbourg, INSERM U1258, CNRS-UMR7104, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France",
        "CNRS, Université de Strasbourg, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, Strasbourg, France",
        "Laboratoire de Génétique Médicale, INSERM URMS_1112, Institut de Génétique Médicale d’Alsace, Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg, Université de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Faculté de Chirurgie Dentaire, Université de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Institut d'études avancées (USIAS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "on behalf of O-Rares Consortium"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Manuela Antin"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Alison Roth"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Jean-Baptiste Lamouche"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Aurélie Gouronc"
    },
    {
      "affiliations": [
        "CNRS, Université de Strasbourg, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Abdelmalek Alioua"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Laboratoire de diagnostic génétique, Nouvel Hôpital Civil, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Laboratoire de Génétique Médicale, INSERM URMS_1112, Institut de Génétique Médicale d’Alsace, Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg, Université de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Caroline Schluth-Bolard"
    },
    {
      "affiliations": [
        "Pôle de Médecine et Chirurgie Bucco-dentaires, Hôpital Civil, Centre de Référence des Maladies Rares Orales et Dentaires, O-Rares, Filière Santé Maladies Rares TETECOU, European Reference Network ERN CRANIO, Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Université de Strasbourg, INSERM U1258, CNRS-UMR7104, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France",
        "Faculté de Chirurgie Dentaire, Université de Strasbourg, Strasbourg, France",
        "Institut d'études avancées (USIAS), Université de Strasbourg, Strasbourg, France"
      ],
      "name": "Agnès Bloch-Zupan"
    }
  ],
  "title": "Diagnosis complexity of dentinogenesis imperfecta involving DSPP genetic variants",
  "uid": "9c6ebd4b-72c6-5ddf-b1b2-feb00d1e02de"
}